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『미생물의 위대한 비밀』은 〈미생물의 세상〉, 〈미생물 세계〉, 〈미생물과 식품〉, 〈식품 저장 및 안전〉, 〈생명공학과 산업〉 등 미생물학의 기초적이고 전반적인 내용이 수록되어 있다.