생물정보학 입문 (2 판)

ARTHURM.LESK

출간작으로『유전체학』등이있다.

1서론1
공간과시간속의생명3
표현형=유전자형+환경+생활사+후생유전학3
진화는생물의세계에서시간이지남에따라변화하는것이다4
생물학적분류및명명법5
도그마(원리):중심원리와주변원리8
정적및역학16
인간게놈18
분자생물학의데이터베이스27
월드와이드웹32
컴퓨터및컴퓨터과학33
Aprèsmoi,ledéluge?너무늦어서죄송합니다!38
연습문제41

2유전학에서게놈까지43
고전유전학의배경43
유전자지도와해석45
DNA서열결정51
차세대염기서열결정55
조립─컴퓨터적측면62
문자열조립64
개인식별에서의게놈학67
윤리,법률및사회적문제74
연습문제75

3인생의전경77
게놈,전사체및단백체77
유전정보전달과정의이해81
게놈서열결정프로젝트81
원핵생물의유전체82
메타게노믹스:일관된환경시료로부터유전체수집87
진핵생물게놈90
사람게놈96
인류학에서유전적다양성102
게놈의진화104
진핵생물의비교유전체학107
연습문제108

4서열정렬및계통도109
서열정렬개요109
점도표와서열정렬115
서열유사성측정117
두서열의정렬계산120
최적의짝간서열정렬을위한역동연산법122
정렬의중요성126
다중서열정렬128
데이터베이스검색을위한다중서열정렬의응용128
계통분류139
계통적관련을결정하기위한서열의이용143
계통도147
진화율이부분적으로다른문제153
베이시안법154
계통도는계통유연관계를나타내는올바른방식인가?154
컴퓨터작업상고려사항155
종합156
연습문제156

5구조생물정보학과신약개발158
서론158
단백질의안정성과접힘160
단백질접힘프로세스165
소수성의응용167
다양한단백질구조에대한설명170
구조의중첩과구조정렬172
단백질구조의진화177
단백질구조의분류179
단백질구조예측및모델링181
신약발굴및개발196
연습문제205

6과학출판물및아카이브:미디어,콘텐츠,액세스및프레젠테이션207
과학문헌207
학술출판물의열람208
전통적인도서관과디지털도서관211
정보의폭발적증가212
데이터베이스215
데이터베이스구축및접속을위한프로그래밍언어및도구227
언어처리230
연습문제241

7인공지능과머신러닝244
인공지능과머신러닝이란무엇인가?244
분류및클러스터링245
인공신경망251
의사결정트리254
서포트벡터머신258
클러스터링259
연습문제265

8시스템생물학개론266
서론266
네트워크와그래프267
역학,안정성및견고성270
시스템생물학을위한발상의일부출처271
버로우-휠러변환274
다른유형의생물학적데이터복잡성277
네트워크분석및비교279
행렬대수에의한그래프분석280
그래프동형280
연습문제282

9대사경로소개283
서론283
단백질기능의분류285
단백질기능예측288
효소에의한촉매작용289
단백질-리간드결합평형291
효소동역학292
효소는새로운기능을어떻게갖게되는가?294
서열,구조및기능의분화에관련된대사경로와한계점300
대사경로의진화와계통발생306
대사경로의정렬308
대사네트워크의역학관계312
연습문제318

10생명체의조절과제어체계319
전사체학320
RNA서열결정322
다양한생리학적상태에서의발현패턴330
초파리생활사기간에유전자발현패턴의변화331
단백질복합체및응집체336
단백질상호작용네트워크338
조절네트워크343
비교적단순한규제통제네트워크의사례346
규제네트워크의논리적구조354
연습문제359
결론361

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