유전체 데이터 분석 2: NGS편, 암과 질병 유전체

유전체 데이터 분석 2: NGS편, 암과 질병 유전체

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Description
“미래를 예측하는 최고의 방법은 우리가 미래를 발명해버리는 것이다.”
- 알란 케이

바이오인포매틱스라는 낯설고 긴 이름의 학문이 국내에 소개된 지도 20여 년이 흘렀다. 초기의 서열 정렬과 분석 알고리즘 연구에서, 대용량 생물학을 촉발한 마이크로어레이 기술, 그리고 생명의과학 전반을 뒤흔든 차세대 시퀀싱 기술과 함께 바이오인포매틱스는 생명과학과 의학의 핵심 분야로 자리 잡았다.

유전체 데이터 분석(I-기초편)은 바이오 정보학의 필요성을 느끼지만 접근에는 어려움을 느낀 생명과학자, 의학자, 통계학자, 전산학자, 공학자 그리고 바이오정보학 분야의 새내기 입문자를 위한 도서로 유전체 데이터 분석(I-기초편)편에 담지 못한 차세대 시퀀싱 (NGS) 분야를 포함하였다. 2편 NGS편도 1편과 마찬가지로 각 실습은 그 개요에 해당하는 이론적 배경을 담은 한 개의 장과 뒤따르는 실습 세 장으로 구성된다. 각 실습은 누구나 쉽게 따라 해 볼 수 있도록 데이터 소개와 분석 전략이 설명되어 있고, 시나리오를 따라 진행되는 예제에 학습목표와 실전문제가 제시되어 있다.

분야의 특성상 대부분 리눅스 환경에서 실행되며 윈도우즈 사용자를 위해 리눅스 가상머신을 모든 실습 코드 및 데이터가 함께 16GB USB 메모리에 담겨 책자와 함께 제공한다.
저자

김주한

M.D.,Ph.D.,M.S.
서울의대졸(88),서울의대의학박사(BrainImaging)
서울대학교병원신경정신과전문의,전임의
미국M.I.T.공학석사,BiomedicalInformatics
(前)미국하버드의대조교수역임,칠드런즈병원
대한의료정보학회이사장,한국생명정보학회장역임
(現)서울의대교수,정보의학,BiomedicalInformatics
서울의대정보의학실장,인간유전체분석실장

목차

chapter1개인유전체시대와바이오·정보·의학
제1장기술융합으로실현되는미래의학…002
제2장바이오빅데이터와네트워크의학시스템의학…022
제3장헬스아바타:개인빅데이터와디지털헬스케어…046

chapter2세상밖으로나온바이오유전체데이터
제4장공개바이오빅데이터와정보의학…066
제5장1,000명유전체사업과사람유전체의다양성…082
제6장ENCODE데이터와UCSC유전체브라우저…102
제7장인간세포주유전체분석공개데이터…124

chapter3NGS데이터분석의이해
제8장차세대염기서열데이터분석의이해와응용…162
제9장차세대시퀀싱데이터포맷다루기…182
제10장서열변이부르기와주석달기…200
제11장서열변이의주석달기와변이기능평가…218

chapter4NGS를이용한암유전체데이터분석
제12장암유전체정보학:돌연변이분석과동반진단,표적치료제,면역치료제…242
제13장암유전체네트워크분석과생존분석…255
제14장NGS를이용한체세포돌연변이분석…268
제15장MAF파일을활용한암유전체돌연변이분석…294
제16장암유전체재배열,복제수변이및상호배타성분석…316
제17장암면역치료와치료반응성바이오마커분석…342
제18장돌연변이공개데이터와난소암생존분석…362

chapter5RNA-Seq전사체데이터분석
제19장RNA-Seq데이터분석의이해와응용…376
제20장RNA-Seq전사체데이터기초분석…390
제21장염기서열수준전사체데이터분석…424
제22장마이크로RNA와비코딩RNA데이터분석…454
제23장eQTL데이터분석…474

chapter6NGS를이용한희귀질환과복잡질환유전체데이터분석
제24장희귀유전질환과흔한복잡질환의유전체학…490
제25장복잡질환의희귀변이연관분석…516
제26장유전자단위의질병유전자탐색법…548
제27장표현형및환경인자기반유전체연관분석…568
제28장개인유전체데이터해석과임상유전체학…580

chapter7부록
응용프로그램설치이용안내서…610

chapter8색인…631